DeepPlant-GEP — 植物基因表达预测（昇腾 NPU 适配）

DeepPlant 是序列级植物调控基因组学基础模型。本仓库为 GEP （Gene Expression Prediction） 子任务模型，输入固定 2500 bp DNA 序列（one-hot 编码），输出 2935 个基因表达特征（expm1 逆变换后）。 约 248.67M 参数，F32，MIT 许可。

架构：ConvNet backbone（反向互补卷积 + 残差卷积塔）→ 6 层 TransformerEncoder（embed 2048 / 8 头）→ AttentionPool → GEP 预测头。

已在 Ascend 910（CANN 8.5.1 / torch_npu 2.9.0.post1）上完成真实推理 验证：NPU_INFERENCE_PASS=True，finite 检查通过，权重 strict 加载。

• 代码：https://github.com/Addaoud/DeepPlant
• 论文：Deep-Plant: a supervised foundation model for plant regulatory genomics（bioRxiv 2026）

推理脚本 inference.py，部署说明见 readme.md，真实 NPU 验证证据见 results/。