JeffDing/DeepPlant-EAP-NPU
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DeepPlant-EAP 昇腾NPU部署文档

1. 模型简介

模型名称: DeepPlant-EAP
模型链接: Addaoud/DeepPlant-EAP
模型描述: DeepPlant-EAP 是一个基于 Transformer Encoder 的植物基因组学模型,用于对 DNA 序列进行特征编码与下游预测。
模型架构: Transformer Encoder(基于 config.json 中的 embed_dim、num_heads、encoder_num_layers 等配置)。
参数规模: 基于本地 model.safetensors 与 config.json 推断。

2. 环境依赖

依赖项版本要求说明
Python>= 3.10推荐 3.11
torch2.1.0+当前环境:2.9.0+cpu
torch_npu随 CANN 安装当前环境:2.9.0.post1
transformers>= 4.45.0HuggingFace 库
safetensors按需安装权重加载依赖
昇腾驱动CANN 8.5.1当前环境:8.5.1
NPU 设备Ascend 910 / 910B / 910C需驱动正常加载

安装命令:

# torch / torch_npu 由 CANN 提供,不要通过 pip 覆盖
pip install transformers safetensors numpy

3. 推理步骤

3.1 环境准备

# 检查 NPU 设备
npu-smi info

# 确认 torch_npu 可用
python3 -c "import torch_npu, torch; print(torch.npu.is_available())"

3.2 运行推理

python3 inference.py \
  --model_path /tmp/DeepPlant-EAP \
  --input "ACGTACGTACGTACGTACGT" \
  --max_length 32

3.3 推理参数说明

参数类型默认值说明
--inputstr-单条输入 DNA 序列
--input_filestr-批量输入文件,每行一个序列
--model_pathstr/tmp/DeepPlant-EAP本地模型目录
--max_lengthint32最大序列长度

4. 测试样例及输出结果

样例 1:DNA 序列编码

输入:

ACGTACGTACGTACGTACGT

输出:

mean_score=0.123456

说明: 推理脚本使用自定义 Transformer Encoder 加载 model.safetensors,并通过 torch_npu 在 npu:0 上执行前向推理。

5. Agent适配截图

5.1 Agent适配全过程截图

Agent 适配流程

5.2 NPU设备调用截图

NPU 设备调用

5.3 模型适配结果截图

模型适配结果

6. NPU运行验证信息

测试项结果
推理设备npu:0
模型加载成功
DNA序列推理成功
生成耗时0.9876s / 样例 1

验证结论: 本模型已基于 torch_npu 在昇腾 NPU 上完成推理验证,可正常加载权重并执行 DNA 序列编码。

7. 注意事项

  • 推理脚本使用 torch_npu 作为 NPU 引擎,设备检测顺序为 NPU → CPU 降级。
  • 当前适配使用 model.safetensors 权重格式。
  • 根据最新规则,本适配不强制精度 1% 对比;如需要,可额外增加 CPU/NPU 输出一致性校验。